La vegetación de nuestros árboles, que han sido grandes pulmones para la humanidad en San Juan del Río, han sido motivo de problema pero nadie se preocupa por ellos.
Muchos árboles fueron sembrados para delimitar propiedades de los grandes hacendados así el corredor de San Pedro Ahuacatlán a la Llave, la rivera del río, San Juan árboles como sabinos, ahuehuetes tradicionales en la rivera del río y eucaliptos que es un árbol que se desarrolla muy rápido en su crecimiento como arboles gigantes de 40 metros de altura se calcula que se plantaron hace más de 300 años.
Otros árboles que fueron plantados hace 80 años aproximadamente en el corredor de Senegal de las palomas y camino a Galindo. Desafortunadamente los árboles se han destruido, algunos de manera natural por sus longevidad, otros por la mano del hombre por la tala y por los incendios de pastos, que no son controlados y terminan destruyendo los pulmones naturales.
Varios ambientalistas que proponen proteger a nuestros árboles, pero en realidad no hacen nada, sería interesante rescatar el camino real de San Pedro a la vieja hacienda de la llave un camino que fue usado por las carretas jalado por caballos y reces, sería un detonante con mucha historia.